L'objectif du colloque est de faire le point des connaissance acquises dans les recherches antérieures, de définir les enjeux scientifiques et d'identifier les priorités pour la recherche dans une perspective programmatique.
Il vise à renforcer les couplages entres sciences humaines et sciences bio-géo-physiques.

L'enjeu consiste à mobiliser l'ensemble des différentes communautés scientifiques des organismes de recherche et des universités sur une question clé du développement durable, à l'interface entre les systèmes naturels et les systèmes économiques et sociaux. La stratégie nationale pour le développement durable (SNDD), adoptée en novembre 2003 par le Gouvernement, a prévu explicitement le thème "Eaux et Territoires" comme une des priorités pour la recherche.

Cinq axes de travail ont été identifiés que l'on se propose de documenter à partir de l'analyse de cinq thématiques :

- Le fonctionnement des systèmes biophysiques et la spatialisation ;

- Les systèmes d'information environnementaux ;

- Les impacts réciproques entre société et systèmes biophysiques ;

- Les méthodes et outils pour le pilotage des systèmes ;

- Usage, gouvernance et développement territorial

Cinq thématiques ont été choisies en fonction de l'importance des enjeux sociaux, mais aussi en dehors du cadre des programmes de recherche pré-existants afin de renouveler la réflexion sur les enjeux scientifiques. Elles serviront d'illustration pour dégager les priorités de recherche et seront abordées dans cinq ateliers parallèles, dont les conclusions seront confrontées dans la séance finale :

Atelier 1 - Bassins versants terrestres et côtiers, milieux et développement territorial

Atelier 2 - Natures, cultures et paysages

Atelier 3 - Tensions, partages et conflits

Atelier 4 – Villes et développement urbain

Atelier 5 - Climat et phénomènes extrêmes